相手の手番なのに自分の時間切れ負けになってしまった。のご質問と回答の詳細です。

考えられる理由をご説明いたします。
ＡとＢが対局していると仮定します。Ａが着手してそのデータがサーバーへ届いた時点で、時間を管理しているサーバーの時計では、Ｂの残り時間のカウントダウンが始まります。サーバーとＢの端末の間のネットワークにトラブルが生じ、Ａの着手のデータがＢへ届かない場合、Ａの画面とサーバーの時計ではＢの残り時間がカウントダウンされますが、Ｂの画面では、Ａの着手を認識するまでＡの残り時間がカウントダウンされるため、残り時間の表示に大きな誤差が生じてしまいます。
そのままＢの残り時間が切れてもＡの着手のデータがＢへ届かない場合、サーバーからＡＢ双方の端末にＢの時間切れ負けのデータを送信し、このためＢの画面では相手の手番なのに自分の時間切れ負けという結果となってしまいます。

時間が過ぎても相手が打たない場合、回線にトラブルが生じている可能性がございますので、碁盤右下の［接続確認］ボタンでご確認ください。

また、対局中操作が効かなくなってしまった場合、そのまま放置すると時間切れ負けになってまう可能性がありますので、PANDA-EGG を強制終了してすぐに再接続して中断後5分以内に対局を再開してください。